O Colégio Cecília Meireles atende no Ensino Fundamental II alunos do 6º ano e 9º ano.
Nesta etapa o adolescente compreende que a aprendizagem adquirida é base para novos conhecimentos, sendo assim o Colégio oferece nesta fase de aprendizagem, aulas dinâmicas onde os alunos se tornam autônomos e protagonistas de sua própria aprendizagem.
O Ensino Fundamental II trabalha com o programa Líder em Mim , sendo um programa socioemocional que atende as habilidades exigidas no BNCC (Base Nacional Comum Curricular)
O trabalho proposto nas séries finais do Ensino Fundamental promove a capacidade de investigação, analise e construção de hipóteses incentiva a criatividade e contribui para o desenvolvimento de habilidades e competências dos alunos.
O material didático utilizado é do Sistema de Ensino Anglo que apresenta uma proposta pedagógica que resgata os conhecimentos prévios dos alunos e trabalha conceitos por meio de problemas contextualizados, trazendo atividades que estimulam a experimentação e a reflexão, possibilitando a construção e a apropriação gradativa dos conhecimentos.
O corpo docente conta com profissionais graduados e alguns com mestrado.